Klaster Manajemen mendukung penyelenggaraan pelayanan Puskesmas melalui tata kelola organisasi yang profesional, efektif, dan akuntabel. Kegiatannya meliputi perencanaan, pengelolaan sumber daya, administrasi, keuangan, sistem informasi, peningkatan mutu, keselamatan pasien, manajemen risiko, serta evaluasi kinerja untuk mewujudkan pelayanan kesehatan yang bermutu dan berkelanjutan.
Klaster Kesehatan Ibu dan Anak memberikan pelayanan kesehatan yang menyeluruh mulai dari masa kehamilan, persalinan, nifas, bayi baru lahir, bayi, balita, anak usia prasekolah hingga remaja. Pelayanan dilaksanakan untuk mendukung tumbuh kembang yang optimal, meningkatkan derajat kesehatan ibu dan anak, serta mewujudkan keluarga yang sehat dan berkualitas.
Klaster Kesehatan Dewasa dan Lansia memberikan pelayanan promotif, preventif, kuratif, rehabilitatif, dan paliatif bagi masyarakat usia dewasa hingga lanjut usia. Pelayanan meliputi deteksi dini faktor risiko, pengendalian penyakit tidak menular, pemantauan kesehatan, serta upaya peningkatan kualitas hidup agar masyarakat tetap sehat, aktif, mandiri, dan produktif.
Klaster Penanggulangan Penyakit Menular dan Kesehatan Lingkungan berfokus pada pencegahan, pengendalian, dan penanggulangan penyakit menular serta upaya menciptakan lingkungan yang sehat. Pelayanan meliputi surveilans, penemuan dan tata laksana kasus penyakit menular, inspeksi kesehatan lingkungan, pengawasan kualitas air dan pangan, pemberdayaan masyarakat, serta respons terhadap kejadian luar biasa (KLB).
Lintas Klaster merupakan pelayanan yang mendukung seluruh klaster agar pelayanan kesehatan berjalan secara terpadu, efektif, dan berkesinambungan. Pelayanan ini meliputi pendaftaran, laboratorium, kefarmasian, pelayanan gawat darurat, promosi kesehatan, konsultasi, rujukan, serta koordinasi antarprofesi untuk memberikan pelayanan yang berorientasi pada kebutuhan pasien.